Различие в значении см. в Словаре трудностей.
Предложенный Вами вариант корректен.
Правильно: внедрение во что? (в производство).
В использовании кавычек нет необходимости.
Правильно: директор ГОУ СПО «Педагогический колледж».
По основному правилу тире не требуется, но можно поставить интонационное тире.
Это сочетание лексически избыточное, плеонастичное, поскольку слова внедрение и инновация имеют общие семантические компоненты.